技术简介
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,是新一代超微量ChIP-Seq技术,适用于无ChIP级别抗体的蛋白研究。与传统的ChIP-Seq研究方法相比,该技术无需交联、超声打断、末端抹平和接头连接等操作,因此具有省时高 效、所需的样品量少、背景信号低和可重复性好等优点,甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag有望将蛋白质-DNA互作的研究变成一种类似PCR反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有革命性的意义。
产品优势
样品起始量低:能够对及少量样品进行分析
无需ChIP级别抗体:无需提供ChIP级别抗体
性价比高:背景噪音低,所需测序深度少
实验重复性好:实验重复结果一致性好
技术原理
ChiTag是Protein AG蛋白与Tn5转座酶的融合蛋白,当抗体结合目的蛋白(如转录因子、组蛋白等)后,Protein AG蛋白可直接结合抗体,携带的Tn5转座酶可特异性的切割目的蛋白附近的DNA pian段,并将DNA pian段连上接头,文库构建之后可进行高通量测序。
图注: CUT&Tag实验流程
案例解析
CUT&Tag技术研究蛋白质-DNA互作的优势
原文:CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells
期刊:Nature Communications 发表时间:20190429 影响因子: 11.878
在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎涉及所有的生命活动。目前研究两者互作的方法很多,作者选择了传统的研究手段ChIP-seq,优化的CUT&RUN方法,以及新方法CUT&Tag共同研究组蛋白H3K27me3。通过比对实验结果,发现CUT&Tag有*低的背景噪声以及zui强的信号。通过对H3K4me1修饰物进行分析,显示CUT&Tag的灵敏度*高,实验可重复性*好。
图注. CUT&Tag方法的优点
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产品名称 | 货号 | 规格 | 品牌 |
CUTANA™ pAG-Tn5 for CUT&Tag | 15-1017 | 50reactions | Epicypher |
Anti-Mouse Secondary Antibody for CUTANA™ CUT&Tag Workflows | 13-0048 | 250reactions | Epicypher |
Anti-Rabbit Secondary Antibody for CUTANA™ CUT&Tag Workflows | 13-0047 | 250reactions | Epicypher |
CUTANA™ Rabbit IgG CUT&RUN Negative Control Antibody | 13-0042 | 100µg | Epicypher |
Histone H3K4me3 Antibody: SNAP-ChIP® Certified, CUTANA™ CUT&RUN Compatible | 13-0041 | 100µg | Epicypher |
CUTANA™ E. coli Spike-in DNA | 18-1401 | 100ng | Epicypher |