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您的 BRCA1/2 测试足够吗?

发布时间: 2024-06-28  点击次数: 60次

乳腺癌易感基因 1 和 2(BRCA1 和 BRCA2)编码的蛋白质起着肿瘤抑制因子的作用,以维持基因组稳定性。BRCA1/2 基因突变可导致 DNA 损伤,显著增加罹患各种癌症的风险,尤其是乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌和胰腺癌。BRCA1 和 BRCA2 的致病突变分别使乳腺癌风险增加 7.6 倍或 5.2 倍。1虽然普通人群中乳腺癌和卵巢癌的终生风险分别为 12% 和 1.3%,但 BRCA1 突变携带者的累积终生风险分别为 72% 和 44%,BRCA2 突变携带者的累积终生风险分别为 69% 和 17% 。2

临床研究表明,BRCA1/2 基因突变与多种癌症对聚 ADP 核糖聚合酶 (PARP) 抑制剂的敏感性有关。3-6美国 食品药品监督管理局 (FDA) 已批准四种 PARP 抑制剂作为乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌或胰腺癌 BRCA1/2 突变患者的单一疗法或维持疗法:奥拉帕尼、鲁卡帕尼、尼拉帕尼和他拉唑帕尼。7因此,准确检测 BRCA1/2 突变对疾病的临床管理(包括是否适合接受 PARP 抑制剂治疗)具有巨大影响。

BRCA1/2 突变可以是单核苷酸变异 (SNV)、小插入/缺失 (INDEL) 或大基因组重排 (LGR),后者被定义为涉及一个或多个外显子的很大一部分的缺失或插入。LGR 占 BRCA1 致病突变的 27% 和 BRCA2 致病突变的 5%,在某些人群中,强大的奠基者效应占所有癌症诊断的约 1/ 3。8

可以使用基于下一代测序 (NGS) 或聚合酶链反应 (PCR) 的方法检测 BRCA1/2 中的 SNV 和小 INDEL 突变。然而,PCR 受限于低复杂性和仅能检测已知的 BRCA1/2 突变。虽然广泛使用的短读 NGS 面板方法能够高通量检测 BRCA1/2 中的所有可能突变,但如果不对测序流程进行额外修改,通常无法检测 LGR。因此,在使用基于 PCR 的方法或 NGS 面板(当前诊断市场上使用广泛的两种技术)进行分子筛选时,BRCA1/2 LGR 经常被遗漏。因此,BRCA1/2 LGR 的检测主要依赖于替代的 NGS 独立检测,例如多重连接依赖性探针扩增 (MLPA)、微阵列或全基因组/外显子测序,从而导致成本增加和周转时间延长。9

理想情况下,一次 BRCA1/2 检测应能同时检测所有突变,以帮助指导癌症患者管理中的循证临床决策。在所有可用方法中,NGS 面板可以作为选择测试,当在生物信息学流程和/或面板设计中纳入某些调整以实现拷贝数检测时。在进行流程调整后,需要进行验证过程以证明除了 SNV 和小 INDEL 之外检测 LGR 的有效性。由于含有 LGR 的临床样本稀缺,因此,正如诊断界所推荐的那样,特征明确且类似于患者的参考材料是难以获取的临床样本的理想替代品,用于评估流程的灵敏度和特异性。10

LGC Clinical Diagnostics 开发了一套的 BRCA1/2 LGR 参考材料,以支持行业开发和验证 BRCA1/2 LGR NGS 面板的需求。Seraseq ® BRCA1/2 LGR 参考材料和突变混合物以两种格式提供:

  • Seraseq ® FFPE BRCA1/2 LGR 参考材料为肿瘤 BRCA 检测提供了从 DNA 提取开始的全过程控制。

  • Seraseq ® gDNA BRCA1/2 LGR 体细胞/遗传突变混合物以纯化的 DNA 形式提供,其等位基因频率适合体细胞或种系测试,可直接用于文库制备。

这些 BRCA1/2 参考材料均包括 BRCA1 和 BRCA2 基因中的 10 种变异,大小从 SNV 到 500 bp 以上的 INDEL 不等,涵盖各种变异类型,为验证过程提供足够的挑战。点击此处或以下按钮查看我们的产品表:

特点和优点

  • 使用包含对 BRCA 驱动的癌症很重要的生物标志物的高度多路复用的参考材料,自信地开发、监控、验证和挑战基于混合捕获的靶向 NGS 检测。

  • 单个样本含有 20 个致病性 BRCA1/2 变异(11 个 LGR、9 个缺失、5 个 SNV、4 个插入缺失和 2 个插入)。

  • 通过高灵敏度的 dPCR 检测定量突变目标,并通过 NGS 进行正交分析。

  • 所有突变均与已充分表征的 GM24385 人类基因组 DNA 混合作为“野生型"背景材料。

  • 可用作全过程(FFPE curl)或纯化的基因组 DNA,具有适合体细胞或种系测试的各种等位基因频率。

  • 在符合 GMP 和 ISO 13485 认证的工厂生产。

北京和一生物科技有限公司专业代理antibodiesinc全系列产品,专营进口生物试剂,科学仪器,实验消耗品,化工原料及药物中间体等。公司与诸多国外品牌签下代理,sigmasantaRDAbcamCSTtoxinstreckBiolegendebiosciencesaracarepolyplusBeyotimeNovusmoltox等,能为广大科研用户提供数万种试剂、仪器和实验消耗品。

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